В частности, в целях упорядочения платежей, поступающих в уплату процентов за пользование бюджетными средствами, по видам задолженности бюджетных кредитов, предоставленных из федерального бюджета, введена новая структура кода подвида доходов по ряду видов доходов. Уточнены отдельные разделы, подразделы, целевые статьи и виды расходов бюджетов бюджетной системы РФ. Изменена классификация источников финансирования дефицитов бюджетов, а также классификация операций сектора государственного управления.

Претерпел изменения также список главных администраторов доходов бюджетов и перечень администрируемых ими доходов (приказ Минфина РФ от 16 апреля 2008 г. № 45н «О порядке введения в действие приказа Министерства финансов Российской Федерации от 28 марта 2008 г. № 37н»). Скорректированный порядок применения бюджетной классификации РФ введен в действие с 28 марта 2008 года.