К ведению Департамента отнесены новые вопросы: обязательное социальное страхование от несчастных случаев на производстве и профессиональных заболеваний; координация деятельности Фонда социального страхования РФ по подготовке проектов федеральных законов о страховых тарифах на такое страхование (приказ Министерства здравоохранения и социального развития РФ от 17 октября 2008 г. № 571). При этом Департамент не будет осуществлять нормативное регулирование по вопросам, относящимся к сферам деятельности Федерального фонда обязательного медицинского страхования в части, касающейся медицинского страхования. Ранее Департамент осуществлял некоторые функции совместно с Департаментом развития медицинской помощи и курортного дела. В настоящее время это взаимодействие не предусмотрено в связи с ликвидацией последнего. Теперь перед Департаментом поставлена новая задача — обеспечивать реализацию функций Министерства по внесению в Правительство РФ проектов федеральных законов о страховых тарифах на обязательное социальное страхование от несчастных случаев на производстве и профессиональных заболеваний. Ранее Департамент обеспечивал реализацию функций Министерства по согласованию параметров формирования и структуры бюджетов Пенсионного фонда РФ, ФСС РФ, ФФОМС, а также по внесению в Правительство РФ проектов федеральных законов о бюджетах указанных фондов и об исполнении этих бюджетов.